Η Δεύτερη Σεζόν εξελίσσεται αφότου έχει περάσει ένας χρόνος από την αποτυχία της Μαύρης Εξέγερσης και τον υποτιθέμενο θάνατο του Ζέρο. Η Βρετανία έχει ορίσει την Περιοχή 11 σε μια κατάσταση εκπαιδευτικής αναμόρφωσης, όπου οι Ενδέκατοι τιμωρούνται και αντιμετωπίζονται με άσχημο τρόπο, για να αποτραπεί οποιαδήποτε σκέψη για μελλοντική εξέγερση. Ο ανυποψίαστος μαθητής Λελούς, χωρίς να γνωρίζει το επαναστατικό παρελθόν του ως Ζέρο, πέφτει πάνω σε μια επιχείρηση για την παγίδευση της μυστηριώδους γυναίκας C.C., η οποία θα του αποκαλύψει τον ξεχασμένο του σκοπό και τον πραγματικό του εαυτό. Εξοντώνοντας αυτούς που τον καταδιώκουν και ανακηρύσσοντας τον εαυτό του ξανά ως Ζέρο, ο Λελούς θα ξεκινήσει ξανά για να τελειώσει αυτό που άρχισε.