Ο Ash και η παρέα του βρίσκονται στην πόλη Altomare. Δύο κλέφτες (Annie και Oakley) σχεδιάζουν να κλέψουν ένα παντοδύναμο μαγικό πετράδι, το Soul Dew, που φυλάσσεται από τα Pokemon Latios και Latias. Τα δυο αυτά Pokemon είχαν σώσει στο παρελθόν χρησιμοποιώντας το Soul Dew την πόλη.Τώρα ο Ash και η παρέα του πρέπει να σταματήσουν τους κλέφτες και να σώσουν την πόλη από την καταστροφή.